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Repositorio de documentación del clúster HPC ctcomp2
(Volver a la Guía de usuario del clúster HPC ctcomp2)
Hardware
- 8 servidores blade HP Proliant BL685c G7
- 4x AMD Opteron 6262HE (16 cores, 1.6GHz, 16MB L3)
- 2 switches 10Gb dúales: Blade HP 6120xg
- (Exclusivos iSCSI) 2 switches 1Gb: HP GbE2c Layer 2/3 Ethernet Blade
HP ProLiant BL685c G7 Server Blade | HP manuals |
---|---|
Blade de servidor HP ProLiant BL685c G7- Especificaciones | |
HP BladeSystem c7000 Enclosures | |
Procesador AMD Opteron 6262 HE | Procesadores AMD Opteron™ Serie 6200 |
amd_opteron_6000_comparison.pdf | |
HP 6120XG Ethernet Blade Switch | HP specifications |
Software
GCC | Manual GCC 4.7.2 |
---|---|
GCC + OpenMP | |
JAVA | http://www.java.com/es/about/ |
Tamaño del heap de JAVA | |
Python | http://www.python.org/doc/ |
Instalar/actualizar/desinstalar paquetes Python |
Software (administración)
Instalar paquetes R
Ejemplo de instalación del paquete nnet
en el $HOME
de usuario del clúster ctcomp2
. Para evitar potenciales problemas, se recomienda realizar la instalación de paquetes en unha sesión interactiva en el frontend
.
- Crear un directorio
~/libR
:mkdir ~/libR
- Iniciamos una sesión interactiva:
qsub -I -q interactive
- Arrancar el entorno R:
module load R R
- Ejecutar el siguiente comando dentro de R:
install.packages("nnet",lib="~/libR/", repos="http://cran.es.r-project.org/")
- Para usar un paquete instalado en
~/libR/
, ejecutar dentro de R:library("nnet", lib.loc="~/libR/")
Instalar/actualizar/desinstalar paquetes Python
En principio, es posible instalar cualquier paquete presente en el índice de paquetes de python. A continuación mostramos un ejemplo de instalación/actualización/desinstalación del paquete pywavelets
en el $HOME
de usuario del clúster ctcomp2
. Para evitar potenciales problemas, se recomienda realizar la instalación de paquetes en una sesión interactiva en el frontend
.
Instalación
Ejecutar el siguiente comando en bash:
pip install --install-option="--user" pywavelets
Actualización
Ejecutar el siguiente comando en bash:
pip install --upgrade pywavelets
Desinstalación
Ejecutar el siguiente comando en bash:
pip uninstall pywavelets