Diferenzas

Isto amosa as diferenzas entre a revisión seleccionada e a versión actual da páxina.

--- centro:servizos:hpc [2023/03/02 13:25] – [Sistema de colas (QOS)] fernando.guillen
+++ centro:servizos:hpc [2024/03/13 10:36] (actual) – [Envío de un trabajo al sistema de colas] fernando.guillen
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 # Instalarlo
 sh Miniconda3-py39_4.11.0-Linux-x86_64.sh
+# Inicializar miniconda para el shell bash
+~/miniconda3/bin/conda init bash
 </code>
 ===== Uso de SLURM =====
 El gestor de colas en el cluster es [[ https://slurm.schedmd.com/documentation.html | SLURM ]]. \\
@@ Liña 267: / Liña 268: @@
 # Hay un alias que muestra solo la información más relevante:
 hpc-login2 ~]$ ver_colas
-      Name   Priority                                  MaxTRES     MaxWall            MaxTRESPU MaxJobsPU MaxSubmitPU
+      Name   Priority                        MaxTRES     MaxWall            MaxTRESPU MaxJobsPU MaxSubmitPU
----------- ---------- ---------------------------------------- ----------- -------------------- --------- -----------
+---------- ---------- ------------------------------ ----------- -------------------- --------- -----------
-   regular        100                cpu=200,gres/gpu=1,node=4  4-04:00:00       cpu=200,node=4        10          50
+   regular        100      cpu=200,gres/gpu=1,node=4  4-04:00:00       cpu=200,node=4        10          50
-interacti+        200                                   node=1    04:00:00               node=1         1           1
+interacti+        200                         node=1    04:00:00               node=1         1           1
-    urgent        300                        gres/gpu=1,node=1    04:00:00               cpu=36         5          15
+    urgent        300              gres/gpu=1,node=1    04:00:00               cpu=36         5          15
-      long        100                        gres/gpu=1,node=4  8-04:00:00                              1           5
+      long        100              gres/gpu=1,node=4  8-04:00:00                              1           5
-     large        100                       cpu=200,gres/gpu=2  4-04:00:00                              2          10
+     large        100             cpu=200,gres/gpu=2  4-04:00:00                              2          10
      admin        500
-     small        150                             cpu=6,node=2    04:00:00              cpu=400        40         100
+     small        100        cpu=6,gres/gpu=0,node=2  6-00:00:00              cpu=400        400         800
+     short        150                   cpu=6,node=2    04:00:00                              40         100
 </code>
 # Priority: es la prioridad relativa de cada cola. \\
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 ==== Envío de un trabajo al sistema de colas ====
 == Especificación de recursos ==
-Por defecto, si se envía un trabajo sin especificar nada el sistema lo envia a la QOS por defecto (regular) y le asigna un nodo, una CPU y toda la memoria disponible. El límite de tiempo para la ejecución del trabajo es el de la cola (4 días y 4 horas).
+Por defecto, si se envía un trabajo sin especificar nada el sistema lo envia a la QOS por defecto (regular) y le asigna un nodo, una CPU y 4 GB de RAM. El límite de tiempo para la ejecución del trabajo es el de la cola (4 días y 4 horas).
 Esto es muy ineficiente, lo ideal es especificar en la medida de lo posible al menos tres parámetros a la hora de enviar los trabajos:
   -  %%El número de nodos (-N o --nodes), tareas (-n o --ntasks) y/o CPU por tarea (-c o --cpus-per-task).%%
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 # Obtener acceso interactivo a un nodo (Pulsar Ctrl+D para terminar el acceso):
 hpc-login2 ~]$ salloc -N1
+# Obtener acceso interactivo a un nodo DE FORMA EXCLUSIVA
+hpc-login2 ~]$ salloc -N1 --exclusive
 </code>
 . SRUN \\