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es:centro:servizos:hpc [2023/03/03 13:57] – [Sistema de colas (QOS)] fernando.guillenes:centro:servizos:hpc [2024/03/13 10:38] (actual) – [Envío de un trabajo al sistema de colas] fernando.guillen
Línea 164: Línea 164:
 # Instalarlo  # Instalarlo 
 sh Miniconda3-py39_4.11.0-Linux-x86_64.sh sh Miniconda3-py39_4.11.0-Linux-x86_64.sh
 +# Inicializar miniconda para el shell bash
 +~/miniconda3/bin/conda init bash
 </code> </code>
  
Línea 284: Línea 286:
 ==== Envío de un trabajo al sistema de colas ==== ==== Envío de un trabajo al sistema de colas ====
 == Especificación de recursos == == Especificación de recursos ==
-Por defecto, si se envía un trabajo sin especificar nada el sistema lo envia a la QOS por defecto (regular) y le asigna un nodo, una CPU y toda la memoria disponible. El límite de tiempo para la ejecución del trabajo es el de la cola (4 días y 4 horas). +Por defecto, si se envía un trabajo sin especificar nada el sistema lo envía a la QOS por defecto (regular) y le asigna un nodo, una CPU y 4GB de RAM. El límite de tiempo para la ejecución del trabajo es el de la cola (4 días y 4 horas). 
 Esto es muy ineficiente, lo ideal es especificar en la medida de lo posible al menos tres parámetros a la hora de enviar los trabajos: Esto es muy ineficiente, lo ideal es especificar en la medida de lo posible al menos tres parámetros a la hora de enviar los trabajos:
   -  %%El número de nodos (-N o --nodes), tareas (-n o --ntasks) y/o CPU por tarea (-c o --cpus-per-task).%%   -  %%El número de nodos (-N o --nodes), tareas (-n o --ntasks) y/o CPU por tarea (-c o --cpus-per-task).%%
Línea 352: Línea 354:
 # Obtener acceso interactivo a un nodo (Pulsar Ctrl+D para terminar el acceso): # Obtener acceso interactivo a un nodo (Pulsar Ctrl+D para terminar el acceso):
 hpc-login2 ~]$ salloc -N1  hpc-login2 ~]$ salloc -N1 
 +# Obtener acceso interactivo a un nodo de forma EXCLUSIVA
 +hpc-login2 ~]$ salloc -N1 --exclusive
 </code> </code>
 3. SRUN \\ 3. SRUN \\
Línea 436: Línea 440:
 JOBID PARTITION     NAME     USER      STATE       TIME  NODES NODELIST(REASON) JOBID PARTITION     NAME     USER      STATE       TIME  NODES NODELIST(REASON)
 6547  defaultPa  example <username>  RUNNING   22:54:55      1 hpc-fat1 6547  defaultPa  example <username>  RUNNING   22:54:55      1 hpc-fat1
 +
 +## Ver estado de uso de las colas del cluster:
 +hpc-login2 ~]$ estado_colas.sh
 +JOBS PER USER:
 +--------------
 +       usuario.uno:  3
 +       usuario.dos:  1
 +
 +JOBS PER QOS:
 +--------------
 +             regular:  3
 +                long:  1
 +
 +JOBS PER STATE:
 +--------------
 +             RUNNING:  3
 +             PENDING:  1
 +==========================================
 +Total JOBS in cluster:  4
 </code> </code>
 Estados (STATE) más comunes de un trabajo: Estados (STATE) más comunes de un trabajo: